Η μεθοδολογία αξιολόγησης των Πράξεων που συγχρηματοδοτούνται από το Πρόγραμμα «Μεταφορές» 2021-2027 βασίζεται στον «Οδηγό για την Αξιολόγηση των προτάσεων (πλην κρατικών ενισχύσεων) που συγχρηματοδοτούνται από τα Προγράμματα που υποστηρίζονται από τα Ταμεία ΕΤΠΑ (στόχος «Επενδύσεις στην απασχόληση και την ανάπτυξη»), ΕΚΤ+, ΤΣ, ΤΔΜ και ΕΤΘΑΥ» που συνέταξε η αρμόδια Υπηρεσία του Υπουργείου Ανάπτυξης και Επενδύσεων.
Η Διαχειριστική Αρχή (ΔΑ) εισηγείται προς έγκριση στην Επιτροπή Παρακολούθησης του Προγράμματος τη μεθοδολογία αξιολόγησης καθώς και τα κριτήρια επιλογής Πράξεων για τις δράσεις του Προγράμματος.
Για τα έργα του Προγράμματος επιλέγεται η άμεση αξιολόγηση, καθώς οι Προσκλήσεις θα απευθύνονται σε συγκεκριμένους δυνητικούς δικαιούχους λόγω της θεσμικής αρμοδιότητάς τους.
Υπάρχουν δύο ομάδες κριτηρίων:
- Κριτήρια Πράξεων (Εκτός Τεχνικής βοήθειας)
- Κριτήρια Πράξεων Τεχνικής Βοήθειας